SMA Masehi 2 PSAK Semarang berdiri sejak tahun 1952 pada waktu itu masih menjadi satu dengan SMA Masehi 1 PSAK Semarang di jalan Dr. Cipto 23 Semarang di bawah naungan Yayasan Pengampu Sekolah dan Asrama Kristen (PSAK) Semarang, berdasarkan Akte Nomor 37 Tanggal 14 Mei 1952 di bawah naungan Yayasan PSAK (Pengampu Sekolah dan Asrama Kristen). Tanah dan bangunan berstatus milik sendiri. Nomor Identitas Sekolah (NIS) adalah 300210, sedangkan Nomor Statistik Sekolah (NSS) adalah 3040363 08017.
Kegiatan belajar mengajar dilaksanakan pada siang hari. Pada tahun ajaran 1984/1985 menempati gedung baru di jalan Gemah Raya No. 8 Semarang dan kegiatan belajar mengajar dilaksanakan dipagi hari.
Status SMA Masehi 2 PSAK Semarang terakreditasi oleh Pemerintah (melalui Badan Akreditasi Sekolah Nasional). Mulai tahun 1994, SMA Masehi 2 PSAK memperoleh status akreditasi ”Disamakan”. Tahun 1999 kembali memperoleh status akreditasi “Disamakan” (peringkat 4 se kota Semarang). Dan pada Tahun 2005 sampai dengan saat ini status akreditasi meningkat lagi menjadi “Terakreditasi Peringkat A (Amat Baik)”.
Adapun yang pernah menjabat Kepala Sekolah di SMA Masehi 2 PSAK urutannya sbb: